Un financement majeur de Génome Québec pour le projet MICROB-AI-R+ de Arnaud Droit

Arnaud Droit, professeur titulaire au Département de médecine moléculaire, et sa collègue Jennifer Geddes-McAlister (University of Guelph) ont remporté un financement majeur de Génome Québec (de 1,25 M$) dans le cadre du programme Solutions génomiques pour l’identification, la caractérisation et la surveillance de la résistance aux antimicrobiens et des pathogènes émergents.

Prix « Coup du cœur ! » du public pour la meilleure présentation par poster aux étudiant.e.s membres du CRDM

FONCER en science des données responsable dans le domaine de la santé (SDRDS), https://sdrds.org/, a organisé la retraite annuelle du programme qui s’est tenue les 15 et 16 novembre 2023 dans un territoire naturel en bordure du lac Saint-Joseph, la Station touristique Duchesnay.
Les membres du programme, chercheur.e.s et étudiant.e.s, ont eu l’occasion de partager leurs fruits de recherche et leurs réflexions et de prendre le temps de discuter, d’échanger, de renforcer les liens existants et à en forger de nouveaux en profitant de l’ambiance champêtre qui surplombe le lac.
Cette année, la retraite s’est focalisée sur les données du monde réel : une occasion de réfléchir et de discuter de la fragmentation, des formats, des normes et de l’interopérabilité des données en santé.

13 étudiant.e.s ont eu l’occasion de présenter leurs travaux de recherche et les meilleurs ont été récompensés par des bourses. Trois prix ont été remis aux étudiant.e.s ayant une implication remarquable dans les activités de formation offertes par FONCER en SDRDS, photo de gauche à droite :

Félicitations aux récipiendaires du prix « Coup du cœur ! » du public pour la meilleure présentation par poster (supplément de bourse de 500 $), photo de gauche à droite :

  • 1ère place : Alexandre Boulay, candidat à la maîtrise à l’Université Laval
  • 2ème place : Johan Ngounou, candidat à la maîtrise à l’Université Laval

Prix « Coup du cœur ! » du public pour la meilleure présentation orale aux étudiant.e.s membres du CRDM

FONCER en science des données responsable dans le domaine de la santé (SDRDS), https://sdrds.org/, a organisé la retraite annuelle du programme qui s’est tenue les 15 et 16 novembre 2023 dans un territoire naturel en bordure du lac Saint-Joseph, la Station touristique Duchesnay.
Les membres du programme, chercheur.e.s et étudiant.e.s, ont eu l’occasion de partager leurs fruits de recherche et leurs réflexions et de prendre le temps de discuter, d’échanger, de renforcer les liens existants et à en forger de nouveaux en profitant de l’ambiance champêtre qui surplombe le lac.
Cette année, la retraite s’est focalisée sur les données du monde réel : une occasion de réfléchir et de discuter de la fragmentation, des formats, des normes et de l’interopérabilité des données en santé.

13 étudiant.e.s ont eu l’occasion de présenter leurs travaux de recherche et les meilleurs ont été récompensés par des bourses. Trois prix ont été remis aux étudiant.e.s ayant une implication remarquable dans les activités de formation offertes par FONCER en SDRDS, photo de gauche à droite :

Félicitations aux récipiendaires du prix « Coup du cœur ! » du public pour la meilleure présentation orale (supplément de bourse de 500 $), photo de gauche à droite :

  • 1ère place : Ronan Lefol, candidat au doctorat à l’Université Laval
  • 2ème place : Ariane Boivin, candidate à la maîtrise à l’Université Laval

Trois prix ont été remis aux étudiant.e.s membres du CRDM ayant une implication remarquable dans les activités de formation offertes par FONCER en SDRDS

FONCER en science des données responsable dans le domaine de la santé (SDRDS), https://sdrds.org/, a organisé la retraite annuelle du programme qui s’est tenue les 15 et 16 novembre 2023 dans un territoire naturel en bordure du lac Saint-Joseph, la Station touristique Duchesnay.
Les membres du programme, chercheur.e.s et étudiant.e.s, ont eu l’occasion de partager leurs fruits de recherche et leurs réflexions et de prendre le temps de discuter, d’échanger, de renforcer les liens existants et à en forger de nouveaux en profitant de l’ambiance champêtre qui surplombe le lac.
Cette année, la retraite s’est focalisée sur les données du monde réel : une occasion de réfléchir et de discuter de la fragmentation, des formats, des normes et de l’interopérabilité des données en santé.

Trois prix ont été remis aux étudiant.e.s ayant une implication remarquable dans les activités de formation offertes par FONCER en SDRDS, photo de gauche à droite :

  • 1ère place avec un supplément de bourse de 2 000 $ : Pierre-Luc Asselin, candidat à la maîtrise à l’Université Laval
  • 2ème place avec un supplément de bourse de 1 000 $: Niloofar Ziasaeedi, candidate au doctorat à l’Université Laval
  • 3ème place avec un supplément de bourse de 1 000 $ : Khawla Seddiki, candidate au doctorat à l’Université Laval

Septembre 2023

Le jeudi 14 septembre 2023 a été marqué par le 5@7 Échanges Éclair 180 : retour sur l’événement et la remise de six prix.
Félicitations à Christian Landry, Jacques Renauld, Leandro C. Coelho et Philippe Després qui ont récemment obtenu des subventions dans le cadre de leurs projets de recherche.
Notre nouvelle section qui vise à souligner les publications conjointes est réservée ce mois-ci aux collaborations de Christian Gagné avec les chercheur.e.s membres du CRDM, aussi vous trouverez un aperçu du parcours et expertise de Claude-Guy Quimper. Nous vous annonçons l’adhésion de Luc Beaulieu et encore d’autres actualités en lien avec Arnaud Droit, Jacques Renauld, Pierre-Luc Déziel et Thierry Badard.
D’autres sections vous attendent, prenez le temps de les lire !

Déterminer la qualité de la polypharmacie chez les aînés : une approche basée sur l’intelligence artificielle

Cette initiative de recherche a reçu une subvention de 1,2 M$ des Instituts de recherche en santé du Canada, en partenariat avec le Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada, dans le cadre du Programme de projets de recherche concertée sur la santé.

La prise de plusieurs médicaments, la polypharmacie, est de plus en plus commune, surtout chez les personnes âgées. Pour l’instant, il n’est pas possible de bien départager quelles polypharmacies apportent des bénéfices et quelles sont inappropriées. En effet, le nombre de combinaisons de médicaments possibles est imposant, et prendre en compte les caractéristiques individuelles de chacune des personnes rend la situation très complexe.

L’intelligence artificielle permettra de comprendre ces éléments pour en dégager des normes. Nous utiliserons les données du Système intégré de surveillance des maladies chroniques du Québec qui contiennent les informations sur les réclamations de médicaments pour l’ensemble des aînés du Québec depuis 1996, de même que les informations sur les services médicaux, les hospitalisations et les décès. Ces données, décrivant l’exposition aux médicaments de chaque individu, permettront d’entraîner un système expert basé sur l’intelligence artificielle pour établir quelles combinaisons, séquences, durées de traitement sont associées à des effets négatifs (ex. hospitalisations, décès) et lesquelles les évitent en tenant compte des conditions médicales et sociodémographiques de la personne. L’analyse de ces données pourrait engendrer des enjeux éthiques, légaux et sociaux que nous explorerons afin d’assurer que les résultats ne conduisent pas à accroître d’éventuelles inégalités dans les traitements que nous observons présentement entre différents sousgroupes de la population.

Les résultats serviront à développer la surveillance de la polypharmacie dans la population et apporteront des connaissances nouvelles sur l’usage de médicaments qui pourraient changer la pratique clinique. De nouvelles avenues de recherche en intelligence artificielle seront également explorées, permettant le développement de cette discipline en santé.

Participants externes : Émond Valérie, Jean Sonia, Savard Anne-Marie et Talbot Denis.

Collaborateurs : Chiu Yohann, Désy Michel, Gagnon Marie-Eve, Morin Michèle et Simard Marc.

Un projet collaboratif de plus de 1,2 M$ ayant recours à l’intelligence artificielle afin d’optimiser la production de vaccins

Le consortium de recherche biopharmaceutique CQDM et Medicago R&D sont fiers d’annoncer aujourd’hui le financement d’un projet de recherche qui permettra à l’entreprise de Québec d’accroître la compétitivité de sa plateforme de production de vaccins et de confirmer sa position de leader dans l’industrie biopharmaceutique au Canada. Via le CQDM, c’est une subvention de 500 000 $ que le ministère de l’Économie et de l’Innovation du Québec octroie pour la réalisation de cette initiative d’une durée de trois ans.

« La crise sanitaire liée à la COVID-19 nous rappelle l’importance de produire des vaccins pour assurer la protection et la santé de la population. Plus que jamais, le gouvernement du Québec juge essentiel de soutenir ce projet de recherche, qui permettra à Medicago, un acteur important de l’industrie biopharmaceutique, d’augmenter sa productivité grâce à l’intelligence artificielle. Nous contribuons du même coup à renforcer la position du Québec comme l’un des centres manufacturiers de vaccins les plus importants au monde » a souligné Pierre Fitzgibbon, ministre de l’Économie et de l’Innovation.

Le projet est mené par l’équipe du professeur Jacques Corbeil, chercheur au département de médecine moléculaire du CHU de Québec-Université Laval, et effectué en étroite collaboration avec Medicago R&D. Le professeur Corbeil est reconnu internationalement pour son expertise pointue à l’interface de la médecine et des approches d’apprentissage automatique. Il est entre autres titulaire de la chaire de recherche du Canada en génomique médicale.

« Il est important de souligner que ce projet est né d’un désir commun d’améliorer la production de vaccins afin de mieux protéger la santé des Canadiens et Canadiennes. Ce fort soutien est particulièrement à point pour mener notre combat contre les maladies émergentes auxquelles nous devons faire face de nos jours, comme la COVID-19 en ce moment », a mentionné le professeur Corbeil.

Apprentissage automatique pour le secteur des assurances: modèles prédictifs, détection de la fraude et équité

Au cœur de leur mission, l’industrie de l’assurance s’efforce de satisfaire ses clients et de leur proposer les produits d’assurance les mieux adaptés à leurs besoins. Grâce aux nombreuses données d’entreprise accumulées au fil des ans, à la disponibilité de ressources de calcul impressionnantes et à l’état actuel des connaissances en matière de recherche en apprentissage automatique, les compagnies d’assurance peuvent désormais s’efforcer de créer des modèles prédictifs efficaces pour certains aspects du comportement du client et leurs besoins. Toutefois, les sociétés d’assurance doivent également rendre des comptes à notre société et, en particulier, cela implique qu’elles ne devraient offrir aucun service ni aucune couverture discriminatoire, en quelque sorte, en termes de race, de couleur de peau, d’origine ethnique ou d’autres caractéristiques non pertinentes qui sont, immuablement, immoral à utiliser. En ce sens, le secteur des assurances devrait également être juste dans le service qu’il fournit.

Par conséquent, la présente proposition de recherche vise à faire progresser l’état actuel des connaissances dans les domaines de la recherche en apprentissage automatique qui intéressent principalement le secteur des assurances. Plus précisément, à partir des données d’entreprise de Beneva, nous visons à créer les modèles prédictifs les plus précis, les plus justes et les plus équitables pour les besoins des clients en matière de produits d’assurance et pour certains aspects de leur comportement, tels que la probabilité qu’un client ne renouvelle pas une assurance donnée. politique. Nous visons également à mettre en place des détecteurs de fraude précis et équitables, capables de détecter la fraude à un stade précoce et de détecter de nouveaux types de fraude. Pour atteindre ces objectifs, nous devrons adapter les algorithmes d’apprentissage automatique existants de manière innovante et en concevoir de nouveaux, tels qu’ils puissent utiliser et combiner différentes sources de données au cours de l’apprentissage, dont certaines sont de nature séquentielle. De plus, nous devrons également trouver des moyens d’imposer l’équité dans les algorithmes d’apprentissage automatique, de sorte que les prédicteurs générés par ceux-ci n’utiliseront pas d’attributs sensibles non pertinents (tels que la race, l’origine ethnique, la religion, etc.) de manière à les rendre performants. inégalement entre différents groupes d’individus.

Forage de données d’assurance: techniques, éthique et sécurité

La compagnie d’assurances canadienne Beneva a accumulé, à travers le temps, plusieurs bases de données massives traitant de leurs clients dans leurs divers programmes d’assurances. Ils recherchent actuellement un moyen d’exploiter ces données afin de mieux comprendre leur clientèle, et ainsi personnaliser leur offre de produits d’assurance aux besoins de chaque individu. Ceci doit être réalisé dans le respect de normes éthiques strictes et des contraintes que les utilisateurs eux-même peuvent vouloir mettre sur l’utilisation de leurs données. Et, considérant la nature personnelle des informations qui seront obtenues sur les individus, la sécurité des données se doit d’être extrêmement robuste. Ce programme de recherche s’oriente donc autour de trois axes fondamentaux. L’axe de forage des données vise à développer de nouveaux algorithmes pour inférer des informations sur les clients à partir de données d’interactions avec la compagnie. L’axe d’éthique et de l’acceptabilité sociale étudie les attentes des clients face à ce forage de données, tant du point de vue des bénéfices qu’ils veulent en tirer que de la protection de leurs vies privées. Et l’axe de sécurité des données développe de nouvelles techniques pour garantir la confidentialité, l’intégrité, la disponibilité, et la traçabilité de ces données. L’industrie de l’assurance vaut plusieurs milliards de dollars dans l’économie canadienne, et la protection des informations personnelles est un sujet d’une grande importance pour la majorité de la population canadienne. Les outils de gestion d’information et de découverte de connaissance que nous allons développer vont donner aux compagnies canadiennes un avantage important dans ce marché international compétitif, tout en garantissant à la population canadienne un contrôle et une protection de ses informations personnelles.

Co-applicants : Khoury, Lyse Langlois, Pierre-Luc Déziel

Collaborateurs : Nadia Tawbi, Josée Desharnais, Mohamed Mejri.

Santé et toxicité de communautés en ligne

Les communautés en ligne abondent aujourd’hui, sur les sites de réseautage social, sites Web de communautés du monde réel comme les écoles ou les clubs, sur le web forums, sur les forums de discussion des jeux vidéo, et même sur les pages de commentaires sites d’information et blogs. Certaines de ces communautés sont « saines » et discussion polie entre membres respectueux, mais d’autres sont « toxiques » et se transformer en combats virulents, à la traîne, à la cyberintimidation, à la fraude, ou même à la l’incitation au suicide, à la radicalisation ou à la prédation sexuelle et au toilettage des Mineurs. La détection des messages toxiques et des utilisateurs toxiques est un défi majeur, en partie parce qu’ils sont des utilisateurs contradictoires qui tentent activement de contourner ou logiciels de détection et filtres. En outre, alors que beaucoup de recherches dans le la littérature s’est penchée sur les communautés en ligne (par exemple dans la normalisation du texte pour corriger les mots mal orthographiés, dans la détection des sentiments pour déduire l’humeur de utilisateurs, ou dans la modélisation utilisateur pour reconnaître les différentes personnalités des utilisateurs), la plupart d’entre eux ont supposé que les utilisateurs collaborent plutôt que délibérément essayer de détourner le logiciel.

La société privée TwoHat dispose d’un logiciel Community Sift, qui aide les modérateurs communautaires à trouver des messages dans les conversations en ligne. Dans ce projet de recherche, nous avec eux afin d’atteindre cinq objectifs généraux, qui seront détaillés dans les sections ultérieures: (1) Pour explorer les améliorations à la gestion de la conversation outils et des mesures d’évaluation de la toxicité dans le contexte du système; (2) Rechercher de nouvelles méthodologies pour la détection de la toxicité en ligne conversations; (3) Développer des algorithmes innovants pour agréger les des éléments d’information dans les dossiers de preuves dans le cadre d’une évaluation cohérente et prédiction; (4) Développer des implémentations en temps réel de ces méthodologies qui peut gérer le flux massif de données des conversations en ligne; (5) Étudier la nature des comportements toxiques, leurs impacts sur les utilisateurs et sur les communautés, et les mécanismes pour les freiner.